洪武初年，元在中原的统治虽已结束，但退据上都的北元还具有一定的军事力量，仍不时窥视着中原，意欲卷土重来。另有元丞相纳哈出率二十万大军屯据东北，夏政权据有四川，元梁王据云南，秦、晋、关、陇地区也有大大小小的武装力量。在这样的形势下，朱元璋的当务之急，无疑是继续征战，消灭割据势力，统一全国。
1387年（洪武二十年），明军出动二十万大军，以冯胜为大将军，蓝玉、傅友德为副将军，大举征讨东北的元丞相纳哈出。强兵压境，纳哈出不敌降明，东北的割据势力被消灭。洪武二十一年，蓝玉奉命率十万大军入漠北，追击北元势力，在捕鱼儿海（今贝儿湖），杀元太尉蛮子，元主脱古思帖木儿在逃亡途中为部将所杀。北元的威胁不复存在。
1371年（洪武四年），朱元璋命汤和、傅友德帅军分两路进击四川，仅用了几个月的时间，便攻克重庆、成都，夏主明昇降，夏政权覆灭。
1381（洪武十四年）九月，傅友德、蓝玉、沐英奉命出师征云南。当年十二月，蓝玉、沐英攻克昆明，傅友德率军攻下乌撒，梁王在逃亡途中自缢而死。翌年二月，大军攻下大理，云南全境悉平。经过20年之久，于1388年最终实现统一大业。
朱元璋趁元末农民战争节节胜利之际，针对元朝势力受到极大削弱，其他作战对象各据一方、互不应援等情况，审时度势，运筹帷幄，恰当任用将帅，攻抚兼施，各个击破，统一全国大部分地区，显示了卓越的用兵才能和驾驭战争的能力。
明洪武元年至二十二年（1368～1389），太祖朱元璋为统一全国，遣军推翻元朝、消灭各地割据政权及元朝残余势力的一系列作战。
元末农民战争后期，朱元璋势力日益强盛，到元至正二十七年（1367），相继攻灭陈友谅和张士诚政权，占据长江中下游广大地区。朱元璋审时度势，决定北伐南征同时并举，命徐达为征虏大将军，常遇春为副将军，北取中原，进克大都（今北京）；汤和为征南将军，消灭割据浙东的方国珍势力；胡廷瑞为征南将军，攻取福建；湖广行省平章杨璟等攻广西。
二十八年正月，在各路大军接连获胜之际，朱元璋于应天（今南京）即帝位，国号大明，建元洪武。随即进行了长达22年的统一战争。
北上灭元，平定西北洪武元年四月，朱元璋得知徐达、常遇春所率北伐军已按既定撤屏蔽、剪羽翼、据户槛之方略，平定山东、河南，占据潼关，孤立大都，遂于五月亲至汴梁（今河南开封），与诸将商讨灭元大计。
之后，徐达遣精兵为先锋，自率主力北渡黄河，攻占邯郸（今属河北）等地。师至临清（今属山东），会合各路军水陆并进，连战皆捷，于八月克大都。元朝灭亡。元顺帝妥懽贴睦尔北走上都（今内蒙古正蓝旗东北），仍用元国号，史称北元。十月，朱元璋诏谕元顺帝父子来归，未果；又以礼相待元故官，安抚归附的北方及蒙古、色目诸百姓，严令诸军毋得骚扰。
十二月，徐达分兵三路克太原、大同、宣府（今河北宣化）等地，迫元将扩廓帖木儿败逃甘肃，山西归明。二年三月，明军入陕西，克西安、凤翔，迫元将李思齐率部10万奔临洮（今属甘肃）。朱元璋致书招降，右副将军冯胜往攻，李思齐出降。五月，徐达乘胜取平凉、延安。
六月，常遇春回师北平（今北京），进克上都，元顺帝北逃应昌（在今内蒙古达来诺尔湖西岸）。八月，徐达克庆阳，斩元将张良臣，占陕西。是年，北元兵袭扰原州、泾州、大同等地，皆被明军击退。
三年，元顺帝病卒，太子爱猷识理达腊袭位，改元宣光。朱元璋以扩廓帖木儿屡扰西北，命徐达为征虏大将军，李文忠、冯胜、邓愈、汤和为副将军，分路出击，先后克定西（今属甘肃）、兴和（今河北张北）、应昌等地，大败扩廓所部，俘元郯王及平章以下将士8.6万余人，元嗣君爱猷识理达腊北走。邓愈率部自临洮进克河州（今甘肃临夏东北），安抚吐蕃，于是河州以西，朵甘、乌斯藏诸部归附明朝。
五年正月，朱元璋命徐达等再次分路征北元。徐达率中路深入岭北，遭北元兵突袭，死伤万余（一说数万），败回；李文忠所率东路亦失利引还；唯冯胜、傅友德率两路获胜，取甘州（今甘肃张掖）、兰州，又击败北元兵于瓜州（今安西西南）、沙州（今敦煌西），控制甘肃。
从六年起，明军改变战法，以守为攻，屡命诸将在山西、北平一带练兵防边。此后，北元兵虽屡扰边，但遭明军反击，不敢深入，明朝基本控制了西北地区局势。
征战福建两广，统一南方在明朝立国前夕，汤和与副将军廖永忠在灭方国珍势力后，出奇兵克福州，旋于洪武元年正月破延平（今南平），执元福建行省平章陈友定；胡廷瑞克建宁（今建瓯）、兴化（今莆田），招降汀州（今长汀）及泉州以南州县；浙江行省平章李文忠率部入闽，歼陈氏余党金子隆等部，占福建。
二月，朱元璋命廖永忠为征南将军，朱亮祖为副将军，由福建海道入广东，与先遣由湖南征广西的杨璟部及江西赣州卫指挥使陆仲亨部互为犄角，进军两广。二月，杨璟部克全州（今属广西）、武冈（今属湖南）等地。四月，廖永忠率部抵广州，元广东行省左丞何真势穷出降。诸路明军入广西，战至七月，相继攻取未下州县。
攻取四川云南，统一西南二年十月，朱元璋趁南征北伐胜利之际，遣使赴蜀招降割据的夏政权首领明升，遭拒绝后，决计用兵。四年正月，朱元璋命汤和为征西将军，周德兴、廖永忠副之，率舟师溯长江而上；傅友德为征虏前将军，顾时副之，率步骑从陕西南下，两路明军水陆并进攻夏。
闰三月，汤和部进攻瞿塘（今四川奉节东）受挫。四月，傅友德部声言出金牛道（川陕栈道），暗率5000精兵出陈仓（今陕西宝鸡市东南），攻克夏军防守薄弱的阶州（今甘肃武都），开辟入川通道，六月克汉州；汤和克夔州（今奉节），抵重庆，明升势穷出降，夏亡。七月，傅友德围成都，夏丞相戴寿以城降。
自五年起，朱元璋多次遣使赴云南招降元梁王把匝刺瓦尔密，均遭杀害，遂于十四年九月命傅友德为征南将军，蓝玉、沐英为左、右副将军，率步骑兵号30万往征。师至湖广境，兵分两路：由都督郭英领兵5万为北路，南趋乌撒（今贵州威宁），以作牵制；傅友德率主力为东路，克普定（今安顺），直趋云南。
十二月，明军用奇正战法，败元司徒平章达里麻部10万，俘达里麻以下2万余人，攻占云南东部门户曲靖。旋由蓝玉、沐英率部进占昆明，元梁王出逃自杀。傅友德北上与郭英会师，大败元右丞实卜，克七星关（今毕节西南），招降附近各州县。
十五年闰二月，蓝玉、沐英攻占大理，俘首领段明弟段世，分兵取云南全境。七月，明军分道进兵乌撒，又平东川、建昌（今四川西昌）、芒部等。十六年，大军班师，留沐英镇守云南。
进军辽东，统一东北三年，北元帝爱猷识理达腊败走漠北后，部将四逃。以太尉纳哈出为首的一部遁入辽东，收残兵20万余，以金山（今吉林双辽东北）为中心，设区置官，割据东北，拒绝朱元璋招降，还屡次出兵袭扰明边，并胁迫高丽（今朝鲜、韩国）国王背明与之结盟。
十三年，朱元璋命徐达、汤和、傅友德从海、陆入辽东，断纳哈出与高丽联系。十八年，命冯胜、傅友德、蓝玉率师会诸道兵至北平操练备征。乘纳哈出势孤，于二十年正月命冯胜为征虏大将军，傅友德、蓝玉副之，率军20万征辽东。五月，冯胜师抵辽河东，获纳哈出屯卒，知其大营虚实。
六月，乘机越过金山，纳哈出降，部众闻败溃散。冯胜旋遣官谕降，得其众4万余人。九月，朱元璋封纳哈出海西侯。命蓝玉为征虏大将军，唐胜宗、郭英副之，率军征漠北。二十一年，蓝玉击败北元主脱占思帖木儿于捕鱼儿海（今俄罗斯贝儿湖）。次年，脱古思被杀，余众投降明朝。
此战，朱元璋趁元末农民战争节节胜利之际，针对元朝势力受到极大削弱，其他作战对象各据一方、互不应援等情况，审时度势，运筹帷幄，恰当任用将帅，攻抚兼施，各个击破，统一全国大部分地区。
