华佗确实被曹操所杀。在罗贯中的《三国演义》里，曹操因被头疾困扰，请华佗医治，华佗提出用利斧砍开曹操脑袋，取出脑中风涎，即可除根的医治办法，然而曹操多疑，认为华佗是想替死去的关羽报仇，所以才给他开颅，一气之下杀了华佗，一代“活死人，肉白骨”的名医就此结束了一生。可是这是罗贯中虚构的情节。在真实历史上，华佗死于建安13年，而关羽死于建安24年，比华佗还晚死11年，何来华佗为关羽报仇？况且首先华佗与关羽并没见过面，著名的华佗给关羽刮骨疗毒一事也是《三国演义》的虚构。曹操的为人十分惜才，不计私仇。这从他收张绣，官渡焚书等可以看出来。华佗是声名远扬的名医，即使是盛怒之下，曹操杀他的可能性也很小。《三国演义》里之所以会设置这样的情节，目的是为了丑化曹操的形象罢了。
那么正史是如何记载曹操杀华佗的呢。据《三国志》记载，华陀在曹操手下干得不顺心，就想辞官回家。但华佗找了一个很烂理由，说老婆有病，我要回家去照顾。结果曹操准许了。但是曹操的疑心很重，就派了一个使者去看望华佗。华陀虽然是名医，但在政治上没有什么城府，对曹操的使者一点戒备都没有。结果使者一进华陀家门，发现华陀的夫人那儿活蹦乱跳。这下让曹操抓住了把柄，曹操把华陀抓回来，认为华陀犯了欺君之罪!于是就把华佗杀了。
曹操
曹操之所以杀华佗，背后还有更深的政治目的。华佗死于建安十三年，正好是曹操大破袁绍。曹操心中此时此刻最想要做的事就是要归拢人心。这就要恩威并施。对能为我所用的人，我给以高官厚禄，对不能为我用的人，那就要给点厉害看看。而华佗真是在这个时候辞官回家，明显是不想为曹操所用，所以曹操正好拿华佗立威。于是华佗就成为了曹操杀一儆百，建立威权的牺牲品。
最后再补充下真实历史上的华佗为人。《后汉书》记载他：“为人性恶，难得意，且耻以医见业！”。也就是说华佗脾气很怪，难与人相处，另外他事实上很讨厌行医。这也就解释了华佗辞官的真实原因。华佗在曹操那里是想做官的，不想当个医生，但曹操就把他当医生用，所以华佗不乐意。顺便说下，在中国古代，医生的社会地位是比较低的，从医会被人。士农工商，医生属于“工”，比农民的地位还低。韩愈曾经说过一句话，“巫医乐师百工之人，君子不齿”。在封建时代只要一说是自己是个医生，下一步可能就这样，人家立马用瞧不起你的眼神看你，“你为啥要干这活?”华佗是有行医的天赋，但打心底里是要摆脱这个行当的。
