《水浒传》的内容从结构上可以分为两大段，第一大段是从高俅出世到梁山大聚义，第二大段是写接受招安，征辽，征方腊。梁山108将在征讨方腊之前一直没有人死亡，但是征讨方腊的时候共有61人阵亡，下面就说一说这些好汉的阵亡顺序及阵亡原因。
梁山好汉与方腊势力的第一场正面交锋是攻打润州，宋江、吴用利用里应外合的计策，攻取了这座江南第一重镇，但是在街头巷战的过程中，宋万、焦挺和陶宗旺这三人阵亡。
梁山军队在占领了润州之后，宋江与卢俊义兵分两路，宋江带人攻打常州和苏州，卢俊义领兵攻打宣州和湖州，宋江在第一次攻打常州的时候作战不利，韩涛和彭玘两人阵亡。与此同时，卢俊义攻打宣州的战争也不顺利，郑天寿、曹正和王定六三人在这场战斗中牺牲。
拿下常州后，宋江开始攻打苏州，宣赞与方腊手下的大将郭世广同归于尽，施恩和孔亮在攻打常熟的时候不幸落水而亡。
梁山军随后开始向杭州发起了总攻，张顺作为先头部队的水军首领，在涌金门侦查敌情的时候被守军发现，守军乱箭齐发，将张顺射死在了水中。董平、张清、周通在攻打杭州城外的独松关时被方腊手下的大将厉天闰和张韬斩杀。雷横在攻打德清县的时候与方腊军中大将司行方大战二十个回合后被斩杀，龚旺与敌方将领黄爱交战的时候，不小心掉入了水中，被对方杀掉。
另一边杭州北关的战斗中，索超和邓飞被方腊军中的头号猛将石宝杀死，刘唐在争夺候潮门的时候被闸板压死。梁山大军冲入北关之后，中了石宝的埋伏，鲍旭在这场遭遇战中阵亡。侯健和段景住走的是水路，没想到在钱塘江上遇到了大风，船被刮翻之后，两人掉入江中被淹死。
攻下了杭州之后，宋江和卢俊义继续分兵，宋江带领部队水陆并发，取道乌龙岭，进攻睦州，由于陆军中途受阻，水军在不明敌情的情况下贸然进攻，险些全军覆没，阮小二在被俘之前挥刀自杀，孟康被敌军的炮火击毙。
得知方腊军惨败之后，宋江开始心浮气躁，同意了解珍、解宝提出的建议，让两人上山放火，企图以此吓退方腊军，没想到方腊军早有准备，将解珍和解宝杀死在山上。接连受挫的宋江计划带领小队人马绕过乌龙岭直接进攻睦州，然后再与留守军队前后夹击，一举攻下乌龙岭。结果在睦州城外与方腊的援军展开了一场遭遇战，王英和扈三娘被敌将郑彪杀害，项充、李衮在混战中阵亡。
在宋江攻打睦州的同时，留守乌龙岭的部队遭到了方腊军队的突袭，石宝带领部队斩杀了燕顺和马麟。这时朝廷派童贯带领援军赶到，与占领了睦州的宋江前后夹击，对乌龙岭发起了最后的总攻，陷入绝境的石宝部队奋勇反抗，用滚木礌石杀掉了郭盛，郭盛的好友吕方则同敌将白钦双双坠落山崖，同归于尽。
与此同时卢俊义带领的另一支部队取道昱岭关进攻歙州，卢俊义派史进、石秀、陈达、杨春、李忠、薛永这六人带领一支三千人的部队取侦查敌情，在途中遇到了庞万春的伏击，几乎全军覆没，六名主将全部被杀，只剩下几名士兵跑了回来。
卢俊义经历了这场惨败之后，决定集中全部兵力，对昱岭关发起总攻，终于拿下了这座关城。紧接着，卢俊义打算乘胜追击，直接攻打歙州。在攻打歙州的第一场交锋中，欧鹏被敌将庞万春放冷箭射死，张青也死在了乱军之中。方腊军队在击败了卢俊义的第一轮进攻之后，准备在晚上劫营，但卢俊义对此早有准备，将劫营的方腊军击退，丁得孙比较惨，他在伏击方腊军队的时候不慎被毒蛇咬伤，中毒而亡。
击退了劫营军后，卢俊义决定一鼓作气拿下歙州，单廷圭、魏定国首当其冲进入了歙州城门，但是遇到了敌将王寅的埋伏，双双阵亡，接下来两军进入了巷战，李云和石勇都被王寅斩杀。
在宋江拿下乌龙岭，卢俊义攻陷歙州之后，两支部队再一次兵合一处，共同向方腊的老巢——清溪城发动了总攻，在第一次攻打清溪城的战役中，秦明在野外遇到了敌将方杰，被方杰斩落马下。宋江为了尽快拿下清溪城，派阮小五和李俊等水军潜入城中，里应外合一举攻破了城门，在巷战阶段，梁山的郁保四、孙二娘被杜微的飞刀杀死，邹渊、杜迁在乱军中被马踩死，李立、蔡福、汤隆也全部阵亡，阮小五被方腊的丞相娄敏中杀害。
