“满蒙联姻”给女真带来了巨大的好处。弱小的女真迅速壮大，后来入关灭明，成为第二个一统中原的少数民族。然而，由于严重的近亲婚配及乱伦婚配，“满蒙联姻”又为清帝国埋下了覆灭的基因。
自顺治入关算起，清朝共历十帝，这十帝基本上满足以下特点:一是，生育能力越来越差。二是，所生子女早夭率很高。三是，皇帝的身体素质越来越差。
据统计，自顺治起十帝一共生育子女146名。其中早夭（未满15岁就夭折）74人，夭折率超过50%，这对于享有顶级医疗资源和生活条件，整体大环境也比较稳定的清皇室来说，未免有些高的不正常。
顺治24岁即死于天花，不过在极为有限的时间里，他还是造出了8子6女。
康熙在位时间最长，生育能力也是清朝巅峰，从14岁开始当爹，一直到65岁止，50年时间生出35子20女，可谓高产。不过，康熙的子女夭折率达到51%…
雍正出了名的“清心寡欲”、“不好声色”，一共只有7位后妃，共10子4女。
乾隆是清帝中的长寿冠军。在位时间与康熙相当，不过论起生了，可远远赶不上他爷爷。一共17子10女。
再接着就一代不如一代了。嘉庆5子9女，夭折率达到57%了。道光9子10女，夭折率37%，而此时已经是医疗相对发达的19世纪了。到咸丰更是断崖式下跌，一生风流的他却只有2子1女，且无一活过20岁。其中就包括19去世的同治。后面的同治、光绪、宣统三帝，均无后而终。且身体素质亦是有名的差。
关于清朝皇帝子女越来越少、身体越来越差的问题。历史学者有不同的看法。
第一种比较靠谱的解释是近亲婚配。纵观清朝十帝，无不都与母亲的近亲有婚配，而借助太后近亲的身份，其子女又能优先获得继承权，从而行成恶性循环。叶赫那拉氏、富察氏、博尔济吉特氏、乌拉喇拉氏等几个满蒙大姓几乎垄断皇位继承权。因而其基因缺陷也就越发的明显。到了后期，已都成了体弱多病的主儿。反而一些王爷贝勒由于这方面宽容一些，身体更好。
第二种说法是汞的影响。我国古代皇室喜欢采用鎏金工艺处理器物，目的是使器物看上去更加华美辉煌。而鎏金工艺涂在器物表面的材料中含有大量的汞。汞是易挥发的重金属，长期吸入会严重损伤身体。明清以来随着鎏金技术的发展，在皇室中的应用也愈发广泛。因而清帝有可能都是汞的影响导致身体变差。
生育能力下降的原因未有定论，但毫无疑问，这也是清朝走向衰落的一个原因。同治、光绪、宣统三帝的先天不足，是200多年恶因生出的果。而发生在他们三人身上的另一件奇事，则令清的衰亡带着些宿命的色彩。
据老太监信修明在《老太监的回忆》中所述，同治、光绪、宣统大婚之夜，“皆当皇后月事来临”，皇帝结婚的重要日子，却三次因为大姨妈“不得圆房”，也难怪最终三位都无后而终了。这就像是上天跟清帝国开的一个天大的玩笑，信修明也感慨“其为命乎？”
